В статье дан ретроспективный анализ экономических проблем научно-технического прогресса и инновационной экономики, представленных в трудах ученых Института экономики начиная с 70-х годов прошлого века и до настоящего времени. Акцентируется важность накопления нематериальной части национального богатства, взаимосвязи его материальной и духовной составляющих. Представлена методология планирования НИОКР, включающая механизмы распределение затрат и классификацию методов планирования, сохраняющая свою актуальность и сегодня. Анализируется научно-технический потенциал страны, а также вопросы управления знаниями в контексте их экономической оценки. Рассмотрены проблемы формирования национальной инновационной системы, государственной активности и нового качества управления в инновационном развитии.